Embora sejamos a agência responsável pela movimentação transfronteiriça de mercadorias em Timor-Leste, outras instituições governamentais podem igualmente ter os seus requisitos específicos. Por exemplo, se estiver a importar ou a exportar alimentos, poderá necessitar obter uma licença do Ministério da Agricultura e Pescas. Na maior parte dos casos o tipo de mercadorias determinará o envolvimento de outras instituições governamentais. As agências podem incluir a Autoridade Portuária de Timor-Leste (APORTIL), o Ministério da Saúde, o Ministério dos Transportes e Comunicações, o Ministério do Turismo, Comércio e Indústria, a Polícia Nacional de Timor-Leste ou o Ministério do Petróleo e Recursos Naturais.