O Comissário Interino da Autoridade Aduaneira é José Fátima Abílio. A nova Estrutura Orgânica da Autoridade Aduaneira (Decreto-Lei N.º 2/2020) entrou em vigor em 2020. Uma alteração importante à estrutura administrativa foi que passámos a ser liderados por um Comissário, nomeado pelo Governo. Anteriormente a Autoridade Aduaneira era liderada por um Diretor-Geral.